故事发生在东京八丈岛近海，这里建成了一座连接了全球各地警方监控摄像的海洋设施“太平洋浮标”。在这座设施正式启动之前，为了与欧洲刑警组织管辖的范围联网，世界各国的IT工程师来到现场。而与此同时，一项应用了人脸识别系统的“新技术”的测试也在进行中……

一年一度的七夕即将到来，东京、神奈、静冈、长野等地却接连发生六起连环杀人案，被害者身边皆留下麻将牌中的七筒和奇怪暗示。由于作案范围过大，各地警署探员纷纷聚到东京警署的专案组共同研究案情，毛利小五郎也被邀请参加，柯南则偷偷听取了会议的内容。会后，柯南无意中听到群马县警部山村操哼唱的童谣，继而发现有黑衣组织的成员混进警察中间。在一次围捕行动中，柯南遇到假扮人质的Vermouth，得知近期一连串的杀人案件与存有组织内部人员资料的记忆卡有关。与此同时，潜入警察内部的间谍偷偷盗取工藤新一和柯南的指纹，新一的身份眼看

秋津政之助（浪川大辅 配音）容易害羞的懦弱性格让他在生活上吃了不少的苦头，因此而丢失的工作更是不计其数。一日，刚刚被解雇的阿政遇见了一神秘男子。男子自称弥一（樱井孝宏 配音），想雇佣阿政担任个人保镖的职务，无所事事的阿政当即答应。没想到这次偶遇竟将阿政卷入了一宗绑架案件中去，而弥一正是江湖大名鼎鼎的犯罪团伙“五叶”的首领。会有怎样的遭遇等待着无辜的阿政呢？　　迫于生计，阿政成为了五叶的一份子。在五叶中，谜一样的弥一，美丽妖艳的阿竹（大浦冬华 配音），刀子嘴豆腐心的梅造（高冢正也 配音），沉默寡言的松吉（内